Las personas tienen la libertad de afiliarse a la administradora que prefieran e incluso cambiarse cuando lo estimen necesario. La Ley establece que los trabajadores que comienzan a cotizar por primera vez deben afiliarse a la AFP que ofrece la menor comisión del mercado, con el objetivo de maximizar el ingreso líquido de los trabajadores.
Los afiliados también pueden escoger el tipo de fondo donde quieren depositar sus ahorros. Cada trabajador puede elegir entre los cinco fondos existentes, optando hasta por dos de ellos al mismo tiempo (Fondo Tipo A, Fondo Tipo B, Fondo Tipo C, Fondo Tipo D y Fondo Tipo E). En caso de no elegir, se le asignará un fondo de acuerdo a su edad, tal como lo determina la Ley.